增值稅適用稅目和稅率的檢查方法如下：

1、掌握增值稅適用數(shù)目和稅率的基本政策；

2、熟悉被查行業(yè)增值稅適用稅目和稅率的基本特點(diǎn)。

3、了解被查對象的經(jīng)管范圍和經(jīng)營內(nèi)容，掌握其適用的基本稅目和基本稅率。

4、觀察被查對象的經(jīng)營過程，檢查被查對象的經(jīng)營合同內(nèi)容，判斷其適用的稅目和稅率是否正確。

5、對被查對象難以判斷屬性和用途的貨物，應(yīng)查閱有關(guān)書籍、咨詢權(quán)威機(jī)構(gòu)，必要時(shí)可以請有關(guān)部門進(jìn)行技術(shù)鑒定，或到上下游企業(yè)進(jìn)行調(diào)查。

6、對被查對象混淆的應(yīng)稅行為，應(yīng)仔細(xì)研究被查對象的經(jīng)營常規(guī)，通過經(jīng)營全鏈條和內(nèi)部核算規(guī)則，分析其適用稅目和稅率的正確性。

7、檢查被查對象是否有因?yàn)闋I改增政策的變化或非主營業(yè)務(wù)的收入，而少繳增值稅的情況。

例如，某企業(yè)2016年5月銀行憑證載收到代扣代繳個(gè)人所得稅手續(xù)費(fèi)28000元，未按規(guī)定按代理經(jīng)紀(jì)服務(wù)繳納增值稅。2016年9月銀行憑證載收到理財(cái)贖回收入21000元，營改增后保本金融商品持有到期需按貸款服務(wù)繳納增值稅，企業(yè)未按規(guī)定繳納貸款服務(wù)增值稅。

8、檢查被查對象是否將高稅率的稅目適用低稅率稅目計(jì)算銷項(xiàng)稅額。

例如，電信企業(yè)提供的TD網(wǎng)絡(luò)容量租賃服務(wù)，如果租賃標(biāo)的物屬于有形動產(chǎn)，則該服務(wù)屬于經(jīng)營租賃服務(wù)，應(yīng)按13%的稅率繳納增值稅；如果租賃標(biāo)的物是波長、帶寬等“無形”的網(wǎng)絡(luò)元素，則該服務(wù)應(yīng)屬于基礎(chǔ)電信服務(wù)，依9%的稅率繳納增值稅。按照《財(cái)政部國家稅務(wù)總局關(guān)于將電信業(yè)納入營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)的通知》（財(cái)稅〔2014）43號)的規(guī)定，基礎(chǔ)電信服務(wù)，是指利用固網(wǎng)、移動網(wǎng)、衛(wèi)星、互聯(lián)網(wǎng)，提供語音通話服務(wù)的業(yè)務(wù)活動，以及出租或者出售帶寬、波長等網(wǎng)絡(luò)元素的業(yè)務(wù)活動。電信企業(yè)來電顯示、呼叫轉(zhuǎn)移、來電等待等業(yè)務(wù)的收入，應(yīng)當(dāng)按照“增值電信業(yè)務(wù)”，依6%的稅率繳納增值稅。再如，將應(yīng)該納人銷售貨物價(jià)外收費(fèi)，按貨物的稅率申報(bào)繳納增值稅的項(xiàng)目，錯(cuò)誤地適用了較低稅率申報(bào)繳納增值稅。

9、檢查被查對象是否將不能夠開具增值稅專用發(fā)票的稅目適用能夠開具值稅專用發(fā)票的稅目計(jì)算銷項(xiàng)稅額。例如，酒店企業(yè)將不可開具增值稅專用發(fā)票的餐飲服務(wù)內(nèi)容按住宿服務(wù)申報(bào)開具增值稅專用發(fā)票。

10、檢查被查對象兼營不同稅目、不同稅率的應(yīng)稅項(xiàng)目，是否未分別核算不同應(yīng)稅項(xiàng)目的銷售額。

11、檢查被查對象涉及的主要會計(jì)科目，包括：原材料、生產(chǎn)成本、主營業(yè)務(wù)收入、其他業(yè)務(wù)收入、營業(yè)外收入、投資收益、資本公積、應(yīng)交稅費(fèi)—應(yīng)交增值稅，等明細(xì)賬及有關(guān)憑證、合同。

來源：《稅務(wù)稽查》節(jié)選。